~ubuntu-branches/ubuntu/raring/bioperl/raring

« back to all changes in this revision

Viewing changes to Bio/Search/Hit/HMMERHit.pm

  • Committer: Bazaar Package Importer
  • Author(s): Charles Plessy
  • Date: 2008-03-18 14:44:57 UTC
  • mfrom: (4 hardy)
  • mto: This revision was merged to the branch mainline in revision 6.
  • Revision ID: james.westby@ubuntu.com-20080318144457-1jjoztrvqwf0gruk
* debian/control:
  - Removed MIA Matt Hope (dopey) from the Uploaders field.
    Thank you for your work, Matt. I hope you are doing well.
  - Downgraded some recommended package to the 'Suggests' priority,
    according to the following discussion on Upstream's mail list.
    http://bioperl.org/pipermail/bioperl-l/2008-March/027379.html
    (Closes: #448890)
* debian/copyright converted to machine-readable format.

Show diffs side-by-side

added added

removed removed

Lines of Context:
1
 
# $Id: HMMERHit.pm,v 1.3 2002/10/22 07:45:17 lapp Exp $
 
1
# $Id: HMMERHit.pm,v 1.6.4.1 2006/10/02 23:10:24 sendu Exp $
2
2
#
3
3
# BioPerl module for Bio::Search::Hit::HMMERHit
4
4
#
35
35
Bioperl modules. Send your comments and suggestions preferably to
36
36
the Bioperl mailing list.  Your participation is much appreciated.
37
37
 
38
 
  bioperl-l@bioperl.org              - General discussion
39
 
  http://bioperl.org/MailList.shtml  - About the mailing lists
 
38
  bioperl-l@bioperl.org                  - General discussion
 
39
  http://bioperl.org/wiki/Mailing_lists  - About the mailing lists
40
40
 
41
41
=head2 Reporting Bugs
42
42
 
43
43
Report bugs to the Bioperl bug tracking system to help us keep track
44
 
of the bugs and their resolution. Bug reports can be submitted via
45
 
email or the web:
 
44
of the bugs and their resolution. Bug reports can be submitted via the
 
45
web:
46
46
 
47
 
  bioperl-bugs@bioperl.org
48
 
  http://bugzilla.bioperl.org/
 
47
  http://bugzilla.open-bio.org/
49
48
 
50
49
=head1 AUTHOR - Jason Stajich
51
50
 
52
51
Email jason@bioperl.org
53
52
 
54
 
Describe contact details here
55
 
 
56
 
=head1 CONTRIBUTORS
57
 
 
58
 
Additional contributors names and emails here
59
 
 
60
53
=head1 APPENDIX
61
54
 
62
55
The rest of the documentation details each of the object methods.
69
62
 
70
63
 
71
64
package Bio::Search::Hit::HMMERHit;
72
 
use vars qw(@ISA);
73
65
use strict;
74
66
 
75
 
use Bio::Search::Hit::GenericHit;
76
67
 
77
 
@ISA = qw(Bio::Search::Hit::GenericHit );
 
68
use base qw(Bio::Search::Hit::GenericHit);
78
69
 
79
70
=head2 new
80
71