~ubuntu-branches/ubuntu/raring/bioperl/raring

« back to all changes in this revision

Viewing changes to Bio/DB/SeqI.pm

  • Committer: Bazaar Package Importer
  • Author(s): Charles Plessy
  • Date: 2008-03-18 14:44:57 UTC
  • mfrom: (4 hardy)
  • mto: This revision was merged to the branch mainline in revision 6.
  • Revision ID: james.westby@ubuntu.com-20080318144457-1jjoztrvqwf0gruk
* debian/control:
  - Removed MIA Matt Hope (dopey) from the Uploaders field.
    Thank you for your work, Matt. I hope you are doing well.
  - Downgraded some recommended package to the 'Suggests' priority,
    according to the following discussion on Upstream's mail list.
    http://bioperl.org/pipermail/bioperl-l/2008-March/027379.html
    (Closes: #448890)
* debian/copyright converted to machine-readable format.

Show diffs side-by-side

added added

removed removed

Lines of Context:
1
1
 
2
2
#
3
 
# $Id: SeqI.pm,v 1.7 2002/10/22 07:38:29 lapp Exp $
 
3
# $Id: SeqI.pm,v 1.10.4.1 2006/10/02 23:10:15 sendu Exp $
4
4
#
5
5
# BioPerl module for Bio::DB::SeqI.pm
6
6
#
42
42
Bioperl modules. Send your comments and suggestions preferably to one
43
43
of the Bioperl mailing lists. Your participation is much appreciated.
44
44
 
45
 
  bioperl-l@bioperl.org              - General discussion
46
 
  http://bioperl.org/MailList.shtml  - About the mailing lists
 
45
  bioperl-l@bioperl.org                  - General discussion
 
46
  http://bioperl.org/wiki/Mailing_lists  - About the mailing lists
47
47
 
48
48
=head2 Reporting Bugs
49
49
 
50
50
Report bugs to the Bioperl bug tracking system to help us keep track
51
 
 the bugs and their resolution.
52
 
 Bug reports can be submitted via email or the web:
 
51
the bugs and their resolution.  Bug reports can be submitted via the
 
52
web:
53
53
 
54
 
  bioperl-bugs@bio.perl.org
55
 
  http://bugzilla.bioperl.org/
 
54
  http://bugzilla.open-bio.org/
56
55
 
57
56
=head1 AUTHOR - Ewan Birney
58
57
 
59
58
Email birney@ebi.ac.uk
60
59
 
61
 
Describe contact details here
62
 
 
63
60
=head1 APPENDIX
64
61
 
65
62
The rest of the documentation details each of the object methods. Internal methods are usually preceded with a _
71
68
 
72
69
 
73
70
package Bio::DB::SeqI;
74
 
use vars qw(@ISA);
75
71
use strict;
76
72
 
77
 
# Object preamble - inherits from Bio::Root::Object
78
73
 
79
 
use Bio::DB::RandomAccessI;
80
 
@ISA = qw(Bio::DB::RandomAccessI);
 
74
use base qw(Bio::DB::RandomAccessI);
81
75
 
82
76
=head1 Methods inherieted from Bio::DB::RandomAccessI
83
77