← Back to branch summary

~ubuntu-branches/ubuntu/raring/bioperl/raring

« back to all changes in this revision

Viewing changes to t/data/readtest.exp

  • Committer: Bazaar Package Importer
  • Author(s): Charles Plessy
  • Date: 2008-03-18 14:44:57 UTC
  • mfrom: (4 hardy)
  • mto: This revision was merged to the branch mainline in revision 6.
  • Revision ID: james.westby@ubuntu.com-20080318144457-1jjoztrvqwf0gruk
http://bugs.debian.org/448890
* debian/control:
  - Removed MIA Matt Hope (dopey) from the Uploaders field.
    Thank you for your work, Matt. I hope you are doing well.
  - Downgraded some recommended package to the 'Suggests' priority,
    according to the following discussion on Upstream's mail list.
    http://bioperl.org/pipermail/bioperl-l/2008-March/027379.html
    (Closes: #448890)
* debian/copyright converted to machine-readable format.

Show diffs side-by-side

added added

removed removed

Lines of Context:
t/data/readtest.exp
 
1
ID   (stdin)
 
2
EN   (stdin)
 
3
LN   (stdin)
 
4
LT   SCF
 
5
QR   1107
 
6
AV   7 7 7 7 7 6 6 6 6 4 4 4 6 6 6 6 12 21 24 29 29 19 16 7 7 8 13 
 
7
AV        13 22 22 25 29 29 34 32 35 35 35 35 40 40 51 51 51 45 45 
 
8
AV        45 56 40 40 40 40 40 40 46 46 56 42 42 56 45 40 40 40 40 
 
9
AV        40 42 42 35 33 33 35 35 35 46 56 56 40 40 40 40 34 33 33 
 
10
AV        24 24 12 14 9 11 16 31 31 48 48 48 48 40 20 19 8 6 6 6 
 
11
AV        8 21 25 30 32 32 33 37 40 40 56 56 56 56 42 33 27 15 15 
 
12
AV        15 33 33 42 56 48 44 42 33 33 20 22 13 13 13 22 22 42 44 
 
13
AV        42 42 42 42 42 42 42 38 38 45 45 45 40 37 37 36 40 35 37 
 
14
AV        38 40 40 42 40 45 38 40 42 37 40 40 40 40 45 56 46 42 42 
 
15
AV        42 43 56 56 43 51 45 40 40 40 40 40 44 44 56 39 40 35 36 
 
16
AV        36 40 42 42 42 50 50 44 47 44 56 56 44 44 42 42 40 40 40 
 
17
AV        37 37 40 40 40 45 37 40 35 35 35 35 40 40 40 40 44 44 36 
 
18
AV        36 19 25 14 33 33 35 35 35 40 36 38 37 37 37 42 42 42 42 
 
19
AV        35 35 35 42 37 42 36 36 36 35 35 35 42 42 42 42 42 42 42 
 
20
AV        56 42 42 42 42 42 37 37 42 42 42 42 42 42 34 34 34 42 31 
 
21
AV        32 28 28 28 31 29 33 29 25 17 24 21 17 9 8 10 13 12 17 
 
22
AV        10 9 9 9 10 8 11 11 11 8 9 9 9 8 7 10 8 8 6 6 8 8 12 10 
 
23
AV        9 9 9 9 9 9 9 9 9 9 11 10 9 9 9 13 9 11 9 9 7 7 10 8 8 
 
24
AV        8 9 9 9 9 9 9 9 9 9 9 9 9 7 8 9 9 9 7 7 7 7 7 7 9 9 8 10 
 
25
AV        8 8 8 11 10 11 10 11 9 8 6 8 8 8 8 8 9 11 20 20 16 13 6 
 
26
AV        6 8 8 9 10 10 10 11 13 10 9 9 11 11 15 21 17 13 9 9 10 
 
27
AV        9 9 8 8 8 9 9 9 6 6 8 8 9 13 9 9 9 9 9 9 9 9 9 9 9 9 11 
 
28
AV        8 8 6 6 6 6 13 10 10 8 8 6 6 8 9 10 10 10 9 9 9 10 10 8 
 
29
AV        8 6 6 6 6 11 9 8 12 9 9 9 12 10 9 9 9 8 8 6 6 6 8 9 9 9 
 
30
AV        9 9 9 9 8 4 4 8 8 9 11 16 11 9 8 8 8 8 6 6 8 8 8 9 11 11 
 
31
AV        11 10 6 6 6 6 6 6 6 6 6 8 6 7 9 9 9 9 9 11 10 14 10 13 
 
32
AV        9 9 8 8 8 8 8 9 9 11 11 11 8 7 13 10 12 9 8 8 11 11 8 6 
 
33
AV        8 6 6 9 6 6 9 13 10 8 8 6 6 8 9 7 7 12 12 6 6 8 8 9 6 8 
 
34
AV        8 8 6 6 8 13 11 6 6 6 6 6 6 7 7 6 6 6 6 6 6 6 9 9 8 10 
 
35
AV        6 6 6 6 6 9 6 6 8 6 6 8 8 10 4 4 4 8 9 9 12 12 10 9 8 8 
 
36
AV        6 6 8 6 6 6 6 8 8 4 4 4 6 6 6 6 6 9 7 8 9 8 8 8 10 10 10 
 
37
AV        8 6 6 8 8 8 9 9 6 6 12 6 6 8 9 9 7 7 9 9 9 9 7 7 9 9 9 
 
38
AV        10 8 7 9 9 7 7 7 7 9 7 6 6 6 6 8 8 7 7 9 9 9 13 8 8 6 6 
 
39
AV        9 6 7 7 8 9 8 8 6 6 6 6 8 6 6 6 6 6 8 6 7 6 6 6 7 7 7 9 
 
40
AV        9 10 9 11 11 14 13 13 9 9 9 6 6 8 8 8 8 9 14 10 9 9 7 10 
 
41
AV        9 11 8 8 8 8 10 10 10 9 9 8 8 6 7 7 9 6 6 9 10 11 11 7 
 
42
AV        7 11 10 10 11 9 11 8 8 11 9 9 7 6 6 6 14 8 8 13 11 11 11 
 
43
AV        9 9 9 8 11 6 6 8 8 9 9 8 8 8 8 8 6 9 19 21 15 13 11 9 13 
 
44
AV        9 10 16 16 9 9 9 9 10 9 9 9 6 6 8 8 6 6 10 8 10 9 9 6 6 
 
45
AV        8 8 8 8 8 6 6 8 8 6 6 8 8 8 8 6 6 8 6 6 8 8 8 8 9 12 12 
 
46
AV        12 8 8 9 21 19 15 12 9 9 9 9 9 12 16 11 11 11 12 12 9 7 
 
47
AV        9 9 10 9 8 8 11 13 12 9 9 9 9 10 9 8 8 6 6 9 8 9 9 11 10 
 
48
AV        10 11 10 8 7 8 8 6 6 6 8 9 9 11 11 16 9 9 10 9 9 9 9 9 
 
49
AV        9 9 8 8 6 6 8 8 8 6 6 8 8 9 9 9 9 9 9 9 9 10 9 10 10 11 
 
50
AV        14 21 20 18 14 11 9 6 6 6 7 6 6 8 8 9 9 10 10 10 10 9 9 
 
51
AV        9 11 11 9 10 6 6 8 8 9 9 6 6 6 6 8 8 9 9 9 9 9 7 7 9 9 
 
52
AV        9 9 9 9 9 12 9 9 9 9 9 9 10 12 9 10 10 11 11 11 12 10 7 
 
53
AV        7 9 7 7 9 13 9 9 9 6 6 6 8 8 8 6 6 
 
54
SQ   
 
55
     GATGATTCCG GCTTCGGACG ACTCTAGAGG ATCCCCATTT TTATAGTTTT TATCTTGTAA
 
56
     TAGATGTTTA GATTTTTCGT TGTAATTATT TTCTTTATTG TTGAAATTAG TATCTCTGGG
 
57
     TAATTTATCA TATTCTCTGG AAAATGATTT ACTATCACTA GATACTTCAT AAGATTTATA
 
58
     ATCTTTATTA TGAAAATCAT CTCTATTTTT CAAATTATTA TTATATCTAT CAAAGTTTCT
 
59
     GTCTTCATTA TATCTATTAG CATATCTATC TTTATCTTTA TCCCTATCAC TATATCTATC
 
60
     ATATGGTTCA TCTTGTTCAA CCGATCAGAC TCGATTCGCC ATCGCCTCTA ACGGATGGCC
 
61
     GCTCCCCCTC TCATACCTCG CTCCCCTCGA CATCCCCCGT CTCGCCACCC TATCCGCCCC
 
62
     CTTCATCACC CCCCCTTATC CACACCCTCA CCCCCCGCAT CGCGCACCCA CGACCACCCG
 
63
     AAGAACCGCC CTTACTCCCA AGTACGCCCC GACCTCCATC ACCCTATGCG GTACCACTCC
 
64
     CACCACACCC AGTCCTACTT TCGCCCGCAC ATCGGCCCCG CTTCAGACAG CTCCCAACTA
 
65
     CGCAACCCAC GCTTGTTCTT GTTCACACTC GAATACTCGA ATCTCTCATT ACTCCGCGGA
 
66
     CTCCGCCGCA CCTGTGCACC ATTAACTGTG TAGCGCCTGA ACCGGCACCT CTGATTACCA
 
67
     CTTCCTCCAC CAGCACAGTC CTATTACCGC ATGTCGCTCT GCTAAGACAG TGCAAGACTC
 
68
     TGCGGTCGCT CTGACCCGCA TCCGCCAGGG CACCTCTCAC CCTCGCTGGC CACCCCGCCC
 
69
     CCCTCTCCCT GCCCCTTCAT TCCCCCAAAC CGCTTTCAAC GGGACACACC CCTCCGCGGC
 
70
     GGACCACAAC TCGCCGTCGG CCACCACTCA CACCTTCCCT CCTCCTTCCC CCACATCACG
 
71
     CCAACCCCGT GGGACGGCTC TCCCGCGGCT ACGACGCGCA ACCCCCCCTC GCCGCTTCCC
 
72
     CCCCAACTTC CCACGGGCTC CCCTCCGCCC CTTACCCGCG AGGAGCTTCA CCCGCGAACC
 
73
     ACCTCCCCCC TTTCCCAACA GCACCG
 
74
//