~ubuntu-branches/ubuntu/raring/bioperl/raring

« back to all changes in this revision

Viewing changes to Bio/Seq/RichSeq.pm

  • Committer: Bazaar Package Importer
  • Author(s): Charles Plessy
  • Date: 2008-03-18 14:44:57 UTC
  • mfrom: (4 hardy)
  • mto: This revision was merged to the branch mainline in revision 6.
  • Revision ID: james.westby@ubuntu.com-20080318144457-1jjoztrvqwf0gruk
* debian/control:
  - Removed MIA Matt Hope (dopey) from the Uploaders field.
    Thank you for your work, Matt. I hope you are doing well.
  - Downgraded some recommended package to the 'Suggests' priority,
    according to the following discussion on Upstream's mail list.
    http://bioperl.org/pipermail/bioperl-l/2008-March/027379.html
    (Closes: #448890)
* debian/copyright converted to machine-readable format.

Show diffs side-by-side

added added

removed removed

Lines of Context:
1
 
# $Id: RichSeq.pm,v 1.15 2003/05/17 19:03:57 heikki Exp $
 
1
# $Id: RichSeq.pm,v 1.19.4.1 2006/10/02 23:10:27 sendu Exp $
2
2
#
3
3
# BioPerl module for Bio::Seq::RichSeq
4
4
#
54
54
 to one of the Bioperl mailing lists.
55
55
Your participation is much appreciated.
56
56
 
57
 
  bioperl-l@bioperl.org                 - General discussion
58
 
  http://bio.perl.org/MailList.html             - About the mailing lists
 
57
  bioperl-l@bioperl.org                  - General discussion
 
58
  http://bioperl.org/wiki/Mailing_lists  - About the mailing lists
59
59
 
60
60
=head2 Reporting Bugs
61
61
 
62
62
Report bugs to the Bioperl bug tracking system to help us keep track
63
 
 the bugs and their resolution.
64
 
 Bug reports can be submitted via email or the web:
 
63
the bugs and their resolution.  Bug reports can be submitted via the
 
64
web:
65
65
 
66
 
  bioperl-bugs@bio.perl.org
67
 
  http://bugzilla.bioperl.org/
 
66
  http://bugzilla.open-bio.org/
68
67
 
69
68
=head1 AUTHOR - Ewan Birney
70
69
 
71
70
Email birney@ebi.ac.uk
72
71
 
73
 
Describe contact details here
74
 
 
75
72
=head1 APPENDIX
76
73
 
77
 
The rest of the documentation details each of the object methods. Internal methods are usually preceded with a _
 
74
The rest of the documentation details each of the object
 
75
methods. Internal methods are usually preceded with a _
78
76
 
79
77
=cut
80
78
 
83
81
 
84
82
 
85
83
package Bio::Seq::RichSeq;
86
 
use vars qw($AUTOLOAD @ISA);
 
84
use vars qw($AUTOLOAD);
87
85
use strict;
88
86
 
89
 
# Object preamble - inherits from Bio::Root::Object
90
 
 
91
 
use Bio::Seq;
92
 
use Bio::Seq::RichSeqI;
93
 
 
94
 
@ISA = qw(Bio::Seq Bio::Seq::RichSeqI);
 
87
 
 
88
 
 
89
use base qw(Bio::Seq Bio::Seq::RichSeqI);
95
90
 
96
91
 
97
92
=head2 new