← Back to branch summary

~ubuntu-branches/ubuntu/raring/bioperl/raring

« back to all changes in this revision

Viewing changes to Bio/LiveSeq/SeqI.pm

  • Committer: Bazaar Package Importer
  • Author(s): Charles Plessy
  • Date: 2008-03-18 14:44:57 UTC
  • mfrom: (4 hardy)
  • mto: This revision was merged to the branch mainline in revision 6.
  • Revision ID: james.westby@ubuntu.com-20080318144457-1jjoztrvqwf0gruk
http://bugs.debian.org/448890
* debian/control:
  - Removed MIA Matt Hope (dopey) from the Uploaders field.
    Thank you for your work, Matt. I hope you are doing well.
  - Downgraded some recommended package to the 'Suggests' priority,
    according to the following discussion on Upstream's mail list.
    http://bioperl.org/pipermail/bioperl-l/2008-March/027379.html
    (Closes: #448890)
* debian/copyright converted to machine-readable format.

Show diffs side-by-side

added added

removed removed

Lines of Context:
Bio/LiveSeq/SeqI.pm
1
 
# $Id: SeqI.pm,v 1.26 2003/06/04 08:36:40 heikki Exp $
 
1
# $Id: SeqI.pm,v 1.31.4.1 2006/10/02 23:10:21 sendu Exp $
2
2
#
3
3
# bioperl module for Bio::LiveSeq::SeqI
4
4
#
40
40
Bioperl modules. Send your comments and suggestions preferably to one
41
41
of the Bioperl mailing lists.  Your participation is much appreciated.
42
42
 
43
 
  bioperl-l@bioperl.org             - General discussion
44
 
  http://bio.perl.org/MailList.html - About the mailing lists
 
43
  bioperl-l@bioperl.org                  - General discussion
 
44
  http://bioperl.org/wiki/Mailing_lists  - About the mailing lists
45
45
 
46
46
=head2 Reporting Bugs
47
47
 
48
48
Report bugs to the Bioperl bug tracking system to help us keep track
49
 
the bugs and their resolution.  Bug reports can be submitted via email
50
 
or the web:
 
49
the bugs and their resolution.  Bug reports can be submitted via the
 
50
web:
51
51
 
52
 
  bioperl-bugs@bio.perl.org
53
 
  http://bugzilla.bioperl.org/
 
52
  http://bugzilla.open-bio.org/
54
53
 
55
54
=head1 AUTHOR - Joseph A.L. Insana
56
55
 
57
56
Email:  Insana@ebi.ac.uk, jinsana@gmx.net
58
57
 
59
 
Address: 
60
 
 
61
 
     EMBL Outstation, European Bioinformatics Institute
62
 
     Wellcome Trust Genome Campus, Hinxton
63
 
     Cambs. CB10 1SD, United Kingdom 
64
 
 
65
58
=head1 APPENDIX
66
59
 
67
60
The rest of the documentation details each of the object
84
77
 
85
78
package Bio::LiveSeq::SeqI;
86
79
use strict;
87
 
use vars qw(@ISA);
88
 
use Bio::LiveSeq::ChainI; # to inherit from it
89
80
use Bio::Tools::CodonTable; # for the translate() function
90
 
use Bio::PrimarySeqI;
91
81
 
92
 
@ISA=qw(Bio::Root::Root Bio::LiveSeq::ChainI Bio::PrimarySeqI ); # inherit from ChainI
 
82
use base qw(Bio::Root::Root Bio::LiveSeq::ChainI Bio::PrimarySeqI);
93
83
 
94
84
=head2 seq
95
85