~ubuntu-branches/ubuntu/raring/bioperl/raring

« back to all changes in this revision

Viewing changes to Bio/PopGen/PopulationI.pm

  • Committer: Bazaar Package Importer
  • Author(s): Charles Plessy
  • Date: 2008-03-18 14:44:57 UTC
  • mfrom: (4 hardy)
  • mto: This revision was merged to the branch mainline in revision 6.
  • Revision ID: james.westby@ubuntu.com-20080318144457-1jjoztrvqwf0gruk
* debian/control:
  - Removed MIA Matt Hope (dopey) from the Uploaders field.
    Thank you for your work, Matt. I hope you are doing well.
  - Downgraded some recommended package to the 'Suggests' priority,
    according to the following discussion on Upstream's mail list.
    http://bioperl.org/pipermail/bioperl-l/2008-March/027379.html
    (Closes: #448890)
* debian/copyright converted to machine-readable format.

Show diffs side-by-side

added added

removed removed

Lines of Context:
1
 
# $Id: PopulationI.pm,v 1.6 2003/07/29 02:53:06 jason Exp $
 
1
# $Id: PopulationI.pm,v 1.9.4.1 2006/10/02 23:10:23 sendu Exp $
2
2
#
3
3
# BioPerl module for Bio::PopGen::PopulationI
4
4
#
50
50
Bioperl modules. Send your comments and suggestions preferably to the
51
51
Bioperl mailing list.  Your participation is much appreciated.
52
52
 
53
 
  bioperl-l@bioperl.org              - General discussion
54
 
  http://bioperl.org/MailList.shtml  - About the mailing lists
 
53
  bioperl-l@bioperl.org                  - General discussion
 
54
  http://bioperl.org/wiki/Mailing_lists  - About the mailing lists
55
55
 
56
56
=head2 Reporting Bugs
57
57
 
59
59
of the bugs and their resolution. Bug reports can be submitted via
60
60
email or the web:
61
61
 
62
 
  http://bugzilla.bioperl.org/
 
62
  http://bugzilla.open-bio.org/
63
63
 
64
64
=head1 AUTHOR - Jason Stajich
65
65
 
81
81
 
82
82
 
83
83
package Bio::PopGen::PopulationI;
84
 
use vars qw(@ISA);
85
84
use strict;
86
85
use Carp;
87
 
use Bio::Root::RootI;
88
86
 
89
 
@ISA = qw( Bio::Root::RootI );
 
87
use base qw(Bio::Root::RootI);
90
88
 
91
89
=head2 name
92
90
 
222
220
}
223
221
 
224
222
 
225
 
=head2 number_individuals
 
223
=head2 get_number_individuals
226
224
 
227
 
 Title   : number_individuals
228
 
 Usage   : my $count = $pop->number_individuals;
 
225
 Title   : get_number_individuals
 
226
 Usage   : my $count = $pop->get_number_individuals;
229
227
 Function: Get the count of the number of individuals
230
228
 Returns : integer >= 0
231
229
 Args    : [optional] marker name, will return a count of the number