← Back to branch summary

~ubuntu-branches/ubuntu/raring/bioperl/raring

« back to all changes in this revision

Viewing changes to t/data/ay007676.gb

  • Committer: Bazaar Package Importer
  • Author(s): Charles Plessy
  • Date: 2008-03-18 14:44:57 UTC
  • mfrom: (4 hardy)
  • mto: This revision was merged to the branch mainline in revision 6.
  • Revision ID: james.westby@ubuntu.com-20080318144457-1jjoztrvqwf0gruk
http://bugs.debian.org/448890
* debian/control:
  - Removed MIA Matt Hope (dopey) from the Uploaders field.
    Thank you for your work, Matt. I hope you are doing well.
  - Downgraded some recommended package to the 'Suggests' priority,
    according to the following discussion on Upstream's mail list.
    http://bioperl.org/pipermail/bioperl-l/2008-March/027379.html
    (Closes: #448890)
* debian/copyright converted to machine-readable format.

Show diffs side-by-side

added added

removed removed

Lines of Context:
t/data/ay007676.gb
 
1
LOCUS       AY007676                1389 bp    DNA     linear   BCT 29-OCT-2001
 
2
DEFINITION  Unknown marine gamma proteobacterium NOR5 16S ribosomal RNA,
 
3
            partial sequence.
 
4
ACCESSION   AY007676
 
5
VERSION     AY007676.1  GI:12000362
 
6
KEYWORDS    .
 
7
SOURCE      unknown marine gamma proteobacterium NOR5
 
8
  ORGANISM  unknown marine gamma proteobacterium NOR5
 
9
            Bacteria; Proteobacteria; Gammaproteobacteria.
 
10
REFERENCE   1  (bases 1 to 1389)
 
11
  AUTHORS   Eilers,H., Pernthaler,J., Peplies,J., Glockner,F.O., Gerdts,G. and
 
12
            Amann,R.
 
13
  TITLE     Isolation of novel pelagic bacteria from the German bight and their
 
14
            seasonal contributions to surface picoplankton
 
15
  JOURNAL   Appl. Environ. Microbiol. 67 (11), 5134-5142 (2001)
 
16
   PUBMED   11679337
 
17
REFERENCE   2  (bases 1 to 1389)
 
18
  AUTHORS   Eilers,H., Pernthaler,J., Peplies,J., Gloeckner,F.O., Gerdts,G.,
 
19
            Schuett,C. and Amann,R.
 
20
  TITLE     Identification and seasonal dominance of culturable marine bacteria
 
21
  JOURNAL   Unpublished
 
22
REFERENCE   3  (bases 1 to 1389)
 
23
  AUTHORS   Eilers,H., Pernthaler,J., Peplies,J., Gloeckner,F.O., Gerdts,G.,
 
24
            Schuett,C. and Amann,R.
 
25
  TITLE     Direct Submission
 
26
  JOURNAL   Submitted (29-AUG-2000) Molecular Ecology, Max-Planck-Institute,
 
27
            Celsiusstrasse 1, Bremen 28359, Germany
 
28
FEATURES             Location/Qualifiers
 
29
     source          1..1389
 
30
                     /organism="unknown marine gamma proteobacterium NOR5"
 
31
                     /mol_type="genomic DNA"
 
32
                     /db_xref="taxon:145658"
 
33
     rRNA            <1..>1389
 
34
                     /product="16S ribosomal RNA"
 
35
ORIGIN      
 
36
        1 cgcgaaagta cttcggtatg agtagagcgg cggacgggtg agtaacgcgt aggaatctat
 
37
       61 ccagtagtgg gggacaactc ggggaaactc gagctaatac cgcatacgtc ctaagggaga
 
38
      121 aagcggggga tcttcggacc tcgcgctatt ggaggagcct gcgttggatt agctagttgg
 
39
      181 tggggtaaag gcctaccaag gcgacgatcc atagctggtc tgagaggatg atcagccaca
 
40
      241 ccgggactga gacacggccc ggactcctac gggaggcagc agtggggaat attgcgcaat
 
41
      301 gggcgaaagc ctgacgcagc catgccgcgt gtgtgaagaa ggccttcggg ttgtaaagca
 
42
      361 ctttcaattg ggaagaaagg ttagtagtta ataactgcta gctgtgacat tacctttaga
 
43
      421 agaagcaccg gctaactccg tgccagcagc cgcggtaata cggaggtgcg agcgttaatc
 
44
      481 ggaattactg ggcgtaaagc gcgcgtaggc ggtctgttaa gtcggatgtg aaagccccgg
 
45
      541 gctcaacctg ggaattgcac ccgatactgg ccgactggag tgcgagagag ggaggtagaa
 
46
      601 ttccacgtgt agcggtgaaa tgcgtagata tgtggaggaa taccggtggc gaaggcggcc
 
47
      661 tcctggctcg acactgacgc tgaggtgcga aagcgtgggg agcaaacagg attagatacc
 
48
      721 ctggtagtcc acgccgtaaa cgatgtctac tagccgttgg gagacttgat ttcttggtgg
 
49
      781 cgaagttaac gcgataagta gaccgcctgg ggagtacggc cgcaaggtta aaactcaaat
 
50
      841 gaattgacgg gggcccgcac aagcggtgga gcatgtggtt taattcgatg caacgcgaag
 
51
      901 aaccttacca ggccttgaca tcctaggaat cctgtagaga tacgggagtg ccttcgggaa
 
52
      961 tctagtgaca ggtgctgcat ggctgtcgtc agctcgtgtc gtgagatgtt gggttaagtc
 
53
     1021 ccgtaacgag cgcaaccctt gtccttagtt gccagcgcgt aatggcggga actctaagga
 
54
     1081 gactgccggt gacaaaccgg aggaaggtgg ggacgacgtc aagtcatcat ggcccttacg
 
55
     1141 gcctgggcta cacacgtgct acaatggaac gcacagaggg cagcaaaccc gcgaggggga
 
56
     1201 gcgaatccca caaaacgttt cgtagtccgg atcggagtct gcaactcgac tccgtgaagt
 
57
     1261 cggaatcgct agtaatcgtg aatcagaatg tcacggtgaa tacgttcccg ggccttgtac
 
58
     1321 acaccgcccg tcacaccatg ggagtgggtt gctccagaag tggttagcct aaccttcggg
 
59
     1381 agggcgatc
 
60
//
 
61