~ubuntu-branches/ubuntu/raring/bioperl/raring

« back to all changes in this revision

Viewing changes to t/data/catalase-webblast.BLASTP

  • Committer: Bazaar Package Importer
  • Author(s): Charles Plessy
  • Date: 2008-03-18 14:44:57 UTC
  • mfrom: (4 hardy)
  • mto: This revision was merged to the branch mainline in revision 6.
  • Revision ID: james.westby@ubuntu.com-20080318144457-1jjoztrvqwf0gruk
* debian/control:
  - Removed MIA Matt Hope (dopey) from the Uploaders field.
    Thank you for your work, Matt. I hope you are doing well.
  - Downgraded some recommended package to the 'Suggests' priority,
    according to the following discussion on Upstream's mail list.
    http://bioperl.org/pipermail/bioperl-l/2008-March/027379.html
    (Closes: #448890)
* debian/copyright converted to machine-readable format.

Show diffs side-by-side

added added

removed removed

Lines of Context:
 
1
BLASTP 2.2.10 [Oct-19-2004]
 
2
 
 
3
Altschul, Stephen F., Thomas L. Madden, Alejandro A. Sch�ffer, 
 
4
Jinghui Zhang, Zheng Zhang, Webb Miller, and David J. Lipman 
 
5
(1997), "Gapped BLAST and PSI-BLAST: a new generation of 
 
6
protein database search programs",  Nucleic Acids Res. 25:3389-3402.
 
7
RID: 1118324516-16598-103707467515.BLASTQ1
 
8
Query= anid_AN8553.1 hypothetical protein 51885 54086 +
 
9
          (528 letters)
 
10
Database: All non-redundant GenBank CDS
 
11
translations+PDB+SwissProt+PIR+PRF excluding environmental samples 
 
12
           2,506,223 sequences; 849,940,114 total letters
 
13
 
 
14
                                                                   Score     E
 
15
Sequences producing significant alignments:                        (Bits)  Value
 
16
 
 
17
gi|40747822|gb|EAA66978.1|  hypothetical protein AN8553.2 [Asp...  1085    0.0   
 
18
gi|66846787|gb|EAL87118.1|  catalase, putative [Aspergillus fumig   785    0.0   
 
19
gi|38326687|gb|AAR17472.1|  catalase [Cochliobolus heterostrophus   716    0.0   
 
20
gi|42553486|gb|EAA76329.1|  hypothetical protein FG06596.1 [Gi...   584    2e-166
 
21
gi|2776|emb|CAA39856.1|  catalase [Pichia angusta] >gi|231690|...   336    1e-91 
 
22
gi|49651945|emb|CAG78888.1|  unnamed protein product [Yarrowia...   331    3e-90 
 
23
gi|56541435|dbj|BAD77826.1|  catalase [Candida dubliniensis]        323    7e-88 
 
24
gi|40738591|gb|EAA57781.1|  hypothetical protein AN5918.2 [Asp...   323    9e-88 
 
25
gi|46440608|gb|EAK99912.1|  hypothetical protein CaO19.6229 [C...   323    9e-88 
 
26
gi|56541439|dbj|BAD77828.1|  catalase [Candida tropicalis]          321    3e-87 
 
27
ALIGNMENTS
 
28
>gi|40747822|gb|EAA66978.1| hypothetical protein AN8553.2 [Aspergillus nidulans FGSC A4]
 
29
 gi|49125822|ref|XP_412690.1| hypothetical protein AN8553.2 [Aspergillus nidulans FGSC A4]
 
30
          Length=528
 
31
 
 
32
 Score = 1085 bits (2807),  Expect = 0.0
 
33
 Identities = 528/528 (100%), Positives = 528/528 (100%), Gaps = 0/528 (0%)
 
34
 
 
35
Query  1    MVTTAQSQCRHATEVRPPEACLWPQTRFFFRNSSTSTGRSCWSAWFILANSSGGSGAFGH  60
 
36
            MVTTAQSQCRHATEVRPPEACLWPQTRFFFRNSSTSTGRSCWSAWFILANSSGGSGAFGH
 
37
Sbjct  1    MVTTAQSQCRHATEVRPPEACLWPQTRFFFRNSSTSTGRSCWSAWFILANSSGGSGAFGH  60
 
38
 
 
39
Query  61   FEVTKDVSDLTKAHFLRSPGIKTPVFIRFSTVTLGREYPDLARNPRGFAVKFYTGEGNYD  120
 
40
            FEVTKDVSDLTKAHFLRSPGIKTPVFIRFSTVTLGREYPDLARNPRGFAVKFYTGEGNYD
 
41
Sbjct  61   FEVTKDVSDLTKAHFLRSPGIKTPVFIRFSTVTLGREYPDLARNPRGFAVKFYTGEGNYD  120
 
42
 
 
43
Query  121  IVGLNFPVFFCRDPIQGPDVIRSQYRNPQNFLLDHNSLFDLLANTPEGNHAGMMFFSDHG  180
 
44
            IVGLNFPVFFCRDPIQGPDVIRSQYRNPQNFLLDHNSLFDLLANTPEGNHAGMMFFSDHG
 
45
Sbjct  121  IVGLNFPVFFCRDPIQGPDVIRSQYRNPQNFLLDHNSLFDLLANTPEGNHAGMMFFSDHG  180
 
46
 
 
47
Query  181  TPAGWQNIHGYGCHTFKWVNAEGKFVYIKYHFLADHGQKQFNADEALRYGGEDPDYSKRE  240
 
48
            TPAGWQNIHGYGCHTFKWVNAEGKFVYIKYHFLADHGQKQFNADEALRYGGEDPDYSKRE
 
49
Sbjct  181  TPAGWQNIHGYGCHTFKWVNAEGKFVYIKYHFLADHGQKQFNADEALRYGGEDPDYSKRE  240
 
50
 
 
51
Query  241  LWRTIENGKELSWTAYVQVMKPEDADPEKLGFDPFDVTKVWPKKQFPLQEFGKLTLNKNP  300
 
52
            LWRTIENGKELSWTAYVQVMKPEDADPEKLGFDPFDVTKVWPKKQFPLQEFGKLTLNKNP
 
53
Sbjct  241  LWRTIENGKELSWTAYVQVMKPEDADPEKLGFDPFDVTKVWPKKQFPLQEFGKLTLNKNP  300
 
54
 
 
55
Query  301  ENFHRDVEQAAFSPGSMVPGIEDSPDPLLQFRMFFYRDAQYHRIGVNLHQVPVNCPFMAS  360
 
56
            ENFHRDVEQAAFSPGSMVPGIEDSPDPLLQFRMFFYRDAQYHRIGVNLHQVPVNCPFMAS
 
57
Sbjct  301  ENFHRDVEQAAFSPGSMVPGIEDSPDPLLQFRMFFYRDAQYHRIGVNLHQVPVNCPFMAS  360
 
58
 
 
59
Query  361  SYSSLNFDGQLRVDANHAMNPQYAPNSFVHKFRTDTAEAPYQLADGTVSRKSHFFHEGKA  420
 
60
            SYSSLNFDGQLRVDANHAMNPQYAPNSFVHKFRTDTAEAPYQLADGTVSRKSHFFHEGKA
 
61
Sbjct  361  SYSSLNFDGQLRVDANHAMNPQYAPNSFVHKFRTDTAEAPYQLADGTVSRKSHFFHEGKA  420
 
62
 
 
63
Query  421  SEYDQPRELYERVMDEKARQHLHTNTARLLKLVEYPKIQAKYLGQLLRISEKYARGVYDL  480
 
64
            SEYDQPRELYERVMDEKARQHLHTNTARLLKLVEYPKIQAKYLGQLLRISEKYARGVYDL
 
65
Sbjct  421  SEYDQPRELYERVMDEKARQHLHTNTARLLKLVEYPKIQAKYLGQLLRISEKYARGVYDL  480
 
66
 
 
67
Query  481  LPEKKFGFDEVQSFakgaevagkeakFRPNMPTDKLLGLCPAMAVYGP  528
 
68
            LPEKKFGFDEVQSFAKGAEVAGKEAKFRPNMPTDKLLGLCPAMAVYGP
 
69
Sbjct  481  LPEKKFGFDEVQSFAKGAEVAGKEAKFRPNMPTDKLLGLCPAMAVYGP  528
 
70
 
 
71
 
 
72
>gi|66846787|gb|EAL87118.1| catalase, putative [Aspergillus fumigatus Af293]
 
73
          Length=573
 
74
 
 
75
 Score =  785 bits (2027),  Expect = 0.0
 
76
 Identities = 383/473 (80%), Positives = 421/473 (89%), Gaps = 9/473 (1%)
 
77
 
 
78
Query  54   GSGAFGHFEVTKDVSDLTKAHFLRSPGIKTPVFIRFSTVTLGREYPDLARNPRGFAVKFY  113
 
79
            GSGAFG+FE TKDVS LTKAHFLRS G++TPVF RFSTVTLGRE+PD ARNPRGFAVKFY
 
80
Sbjct  108  GSGAFGYFETTKDVSSLTKAHFLRSVGVRTPVFARFSTVTLGREFPDEARNPRGFAVKFY  167
 
81
 
 
82
Query  114  TGEGNYDIVGLNFPVFFCRDPIQGPDVIRSQYRNPQNFLLDHNSLFDLLANTPEGNHAGM  173
 
83
            TGEGNYDIVGLNFPVFFCRDPIQGPDVIRSQYRNPQNFLLDHNSLFDLLANTPEGNHAGM
 
84
Sbjct  168  TGEGNYDIVGLNFPVFFCRDPIQGPDVIRSQYRNPQNFLLDHNSLFDLLANTPEGNHAGM  227
 
85
 
 
86
Query  174  MFFSDHGTPAGWQNIHGYGCHTFKWVNAEGKFVYIKYHFLADHGQKQFNADEALRYGGED  233
 
87
            MFFSDHGTP GW+N+HGYGCHTFK VN  G+FVYIKYHF+AD GQKQ  ADEA++  GED
 
88
Sbjct  228  MFFSDHGTPVGWRNLHGYGCHTFK-VNKRGEFVYIKYHFIADRGQKQSTADEAIQMCGED  286
 
89
 
 
90
Query  234  PDYSKRELWRTIENGKELSWTAYVQVMKPEDADPEKLGFDPFDVTKVWPKKQFPLQEFGK  293
 
91
            PD+SKR+L++ IE G+++SWTA+VQ+MKPE+ADP KLGFDPFDVTK        L EFGK
 
92
Sbjct  287  PDFSKRDLYQAIEKGEKISWTAHVQIMKPEEADPTKLGFDPFDVTK--------LHEFGK  338
 
93
 
 
94
Query  294  LTLNKNPENFHRDVEQAAFSPGSMVPGIEDSPDPLLQFRMFFYRDAQYHRIGVNLHQVPV  353
 
95
            L LNKNPENFHRDVEQAAFSPGSMVPGIEDSPDPLLQFRMFFYRDAQYHRIGVNLHQ+PV
 
96
Sbjct  339  LVLNKNPENFHRDVEQAAFSPGSMVPGIEDSPDPLLQFRMFFYRDAQYHRIGVNLHQIPV  398
 
97
 
 
98
Query  354  NCPFMASSYSSLNFDGQLRVDANHAMNPQYAPNSFVHKFRTDTAEAPYQLADGTVSRKSH  413
 
99
            NCPFMASSYSSLNFDG LRVDANHAMNPQYAPNSFVHKFR DTAEAPYQLAD TVSRKSH
 
100
Sbjct  399  NCPFMASSYSSLNFDGPLRVDANHAMNPQYAPNSFVHKFRPDTAEAPYQLADNTVSRKSH  458
 
101
 
 
102
Query  414  FFHEGKASEYDQPRELYERVMDEKARQHLHTNTARLLKLVEYPKIQAKYLGQLLRISEKY  473
 
103
            F+HEGK SEYDQPR LY++VMD + R+HLH NTAR+LK+VEYP+IQ +YL QL  I+ +Y
 
104
Sbjct  459  FYHEGKLSEYDQPRALYQKVMDARGREHLHCNTARMLKVVEYPEIQLRYLTQLYCIAPEY  518
 
105
 
 
106
Query  474  ARGVYDLLPEKKFGFDEVQSFakgaevagkeakFRPNMPTDKLLGLCPAMAVY  526
 
107
            ARGVYDLLPE+KF F +V++ A+GAE  GKEAKFRP+  TD L G CPA  VY
 
108
Sbjct  519  ARGVYDLLPEQKFDFSQVKAQAQGAERVGKEAKFRPSKDTDILAGKCPATPVY  571
 
109
 
 
110
 
 
111
>gi|38326687|gb|AAR17472.1| catalase [Cochliobolus heterostrophus]
 
112
          Length=547
 
113
 
 
114
 Score =  716 bits (1849),  Expect = 0.0
 
115
 Identities = 339/473 (71%), Positives = 398/473 (84%), Gaps = 7/473 (1%)
 
116
 
 
117
Query  54   GSGAFGHFEVTKDVSDLTKAHFLRSPGIKTPVFIRFSTVTLGREYPDLARNPRGFAVKFY  113
 
118
            GSGAFG+FE TKDV+ LTKA FL++ G KTP+FIRFSTVT GREYPD ARNPRGFA+KFY
 
119
Sbjct  80   GSGAFGYFETTKDVTHLTKADFLKTVGEKTPIFIRFSTVTPGREYPDEARNPRGFAIKFY  139
 
120
 
 
121
Query  114  TGEGNYDIVGLNFPVFFCRDPIQGPDVIRSQYRNPQNFLLDHNSLFDLLANTPEGNHAGM  173
 
122
            TGEGNYDIVGLNFPVFFCRDPIQGPDVIRSQ+RNP+NFL D++++FDLLANTPEGNHAG+
 
123
Sbjct  140  TGEGNYDIVGLNFPVFFCRDPIQGPDVIRSQWRNPKNFLFDYDAIFDLLANTPEGNHAGL  199
 
124
 
 
125
Query  174  MFFSDHGTPAGWQNIHGYGCHTFKWVNAEGKFVYIKYHFLADHGQKQFNADEALRYGGED  233
 
126
            MFFSDHGTP GW+  HGYGCHTFKWVN +G+FVYIKYHF+A+HGQKQF  ++A +  GED
 
127
Sbjct  200  MFFSDHGTPQGWRFNHGYGCHTFKWVNKDGQFVYIKYHFVAEHGQKQFTQEQATQMCGED  259
 
128
 
 
129
Query  234  PDYSKRELWRTIENGKELSWTAYVQVMKPEDADPEKLGFDPFDVTKVWPKKQFPLQEFGK  293
 
130
            PDYSKR+L+ TIENG+E+ W A+VQVM PE+ADP+KLGFDPFDVTKVWP+KQFP+QEFG+
 
131
Sbjct  260  PDYSKRDLYETIENGEEVVWKAHVQVMSPEEADPDKLGFDPFDVTKVWPRKQFPMQEFGR  319
 
132
 
 
133
Query  294  LTLNKNPENFHRDVEQAAFSPGSMVPGIEDSPDPLLQFRMFFYRDAQYHRIGVNLHQVPV  353
 
134
            L LNKNPENFHRDVEQAAFSPGSMVPG+EDSPDPLLQFRMFFYRDAQYHRIGVNLHQ+PV
 
135
Sbjct  320  LVLNKNPENFHRDVEQAAFSPGSMVPGVEDSPDPLLQFRMFFYRDAQYHRIGVNLHQIPV  379
 
136
 
 
137
Query  354  NCPFMASSYSSLNFDGQLRVDANHAMNPQYAPNSFVHKFRTDTAEAPYQLADGTVSRKSH  413
 
138
            NCPFMA S++SLNFDGQ+RVDANHA N  YAPNSF HKFR D AEAPYQ+ D  +SRKSH
 
139
Sbjct  380  NCPFMAKSFASLNFDGQMRVDANHAGNKPYAPNSFAHKFRPDVAEAPYQVNDNIMSRKSH  439
 
140
 
 
141
Query  414  FFHEGKASEYDQPRELYERVMDEKARQHLHTNTARLLKLVEYPKIQAKYLGQLLRISEKY  473
 
142
            ++HEGK +EYDQ +EL+ RVM  + +Q+   NTA +LK V YP+IQ   +G  L      
 
143
Sbjct  440  YWHEGKKNEYDQAKELWSRVMSVQEKQNTIKNTANMLKFVRYPEIQQYNIGTDL------  493
 
144
 
 
145
Query  474  ARGVYDLLPEKKFGFDEVQSFakgaevagkeakFRPNMPTDKLLGLCPAMAVY  526
 
146
            +RG+YDLLP+  F F EV+  +  A    KE KFR ++  ++L G  P+M VY
 
147
Sbjct  494  SRGIYDLLPKPAFDFSEVEELSHTAHEWYKEKKFR-SIDGERLTGFPPSMPVY  545
 
148
 
 
149
 
 
150
>gi|42553486|gb|EAA76329.1| hypothetical protein FG06596.1 [Gibberella zeae PH-1]
 
151
 gi|46124437|ref|XP_386772.1| hypothetical protein FG06596.1 [Gibberella zeae PH-1]
 
152
          Length=539
 
153
 
 
154
 Score =  584 bits (1506),  Expect = 2e-166
 
155
 Identities = 281/481 (58%), Positives = 338/481 (70%), Gaps = 57/481 (11%)
 
156
 
 
157
Query  52   SGGSGAFGHFEVTKDVSDLTKAHFLRSPGIKTPVFIRFSTVTLGREYPDLARNPRGFAVK  111
 
158
            S G+GAFG+FE T+DV++LTKA+FL S G KTPVF+RFST TLGRE+PD +RNPRGFA+K
 
159
Sbjct  112  SCGAGAFGYFECTRDVTELTKANFLSSVGEKTPVFVRFSTATLGREFPDASRNPRGFAIK  171
 
160
 
 
161
Query  112  FYTGEGNYDIVGLNFPVFFCRDPIQGPDVIRSQYRNPQNFLLDHNSLFDLLANTPEGNHA  171
 
162
            FYT EGNYDIVGLNFPVFFCRDPIQGPDVIRSQ RNP NFLLDH++LFD LAN PE NHA
 
163
Sbjct  172  FYTKEGNYDIVGLNFPVFFCRDPIQGPDVIRSQSRNPSNFLLDHDALFDFLANNPEANHA  231
 
164
 
 
165
Query  172  GMMFFSDHGTPAGWQNIHGYGCHTFKWVNAEGKFVYIKYHFLADHGQKQFNADEALRYGG  231
 
166
            G+M FSDHGTP GW+  HGYGCHTFKWVNA+G+F+Y+KYHF+A HGQKQF   EA++  G
 
167
Sbjct  232  GIMLFSDHGTPQGWRFSHGYGCHTFKWVNADGEFMYVKYHFIAKHGQKQFADSEAMQMCG  291
 
168
 
 
169
Query  232  EDPDYSKRELWRTIENGKELSWTAYVQVMKPEDADPEKLGFDPFDVTKVWPKKQFPLQEF  291
 
170
            EDPDYSKR+LW  IE G+++ W  +VQ+M P  ADP+ LGFDPFD TK+WP+ +F ++E 
 
171
Sbjct  292  EDPDYSKRDLWEAIEKGEDIEWMVHVQIMDPRQADPDTLGFDPFDATKIWPRSEFRMKEL  351
 
172
 
 
173
Query  292  GKLTLNKNPENFHRDVEQAAFSPGSMVPGIEDSPDPLLQFRMFFYRDAQYHRIGVNLHQV  351
 
174
            G+L LNKNPENFHRDVEQA FSPGSMVPGIEDSPDPLLQFRMF YRDAQYHR+G NLHQ+
 
175
Sbjct  352  GRLVLNKNPENFHRDVEQAVFSPGSMVPGIEDSPDPLLQFRMFLYRDAQYHRVGTNLHQI  411
 
176
 
 
177
Query  352  PVNCPFMASSYSSLNFDGQLRVDANHAMNPQYAPNSFVHKFRTDTAEAPYQLADGTVSRK  411
 
178
            PVNCPFMA SY+S  FDG + VD + A + QY  NSF HKFR DT EAPY++ D  +   
 
179
Sbjct  412  PVNCPFMAKSYAS-PFDGPMHVDTDRAGSKQYPLNSFAHKFRPDTDEAPYEVNDNFI---  467
 
180
 
 
181
Query  412  SHFFHEGKASEYDQPRELYERVMDEKARQHLHTNTARLLKLVEYPKIQAKYLGQLLRISE  471
 
182
                                                             KYL Q+  IS 
 
183
Sbjct  468  -------------------------------------------------KYLAQVYIISV  478
 
184
 
 
185
Query  472  KYARGVYDLLPEKKFGFDEVQSFakgaevagkeakFRP----NMPTDKLLGLCPAMAVYG  527
 
186
             YA+G+Y+LL E +F F +V+   +       +  ++     + P  KL+G  P +AVY 
 
187
Sbjct  479  DYAQGIYNLLDEPRFEFSKVKKLGETKFAEAADDWYKEPKFRDKPGSKLVGYPPEIAVYQ  538
 
188
 
 
189
Query  528  P  528
 
190
            P
 
191
Sbjct  539  P  539
 
192
 
 
193
 
 
194
>gi|2776|emb|CAA39856.1| catalase [Pichia angusta]
 
195
 gi|231690|sp|P30263|CATA_PICAN Peroxisomal catalase
 
196
 gi|228770|prf||1811225A catalase
 
197
          Length=507
 
198
 
 
199
 Score =  336 bits (862),  Expect = 1e-91
 
200
 Identities = 163/331 (49%), Positives = 216/331 (65%), Gaps = 2/331 (0%)
 
201
 
 
202
Query  54   GSGAFGHFEVTKDVSDLTKAHFLRSPGIKTPVFIRFSTVTLGREYPDLARNPRGFAVKFY  113
 
203
            G+GA+G FEVT D++D+  A FL + G KT +F RFSTV   +   D AR+PRGFA KFY
 
204
Sbjct  68   GAGAYGVFEVTDDITDVCSAKFLDTVGKKTRIFTRFSTVGGEKGSADTARDPRGFATKFY  127
 
205
 
 
206
Query  114  TGEGNYDIVGLNFPVFFCRDPIQGPDVIRSQYRNPQNFLLDHNSLFDLLANTPEGNHAGM  173
 
207
            T +GN D+V  N P+FF RDPI+ P  I +Q RNP   L D N  +D L    E  H  M
 
208
Sbjct  128  TEDGNLDLVYNNTPIFFIRDPIKFPHFIHTQKRNPATNLKDPNMFWDYLTANDESLHQVM  187
 
209
 
 
210
Query  174  MFFSDHGTPAGWQNIHGYGCHTFKWVNAEGKFVYIKYHFLADHGQKQFNADEALRYGGED  233
 
211
              FS+ GTPA ++ ++GY  HT+KW N++G++VY++ HF+A+ G      +EA R  GED
 
212
Sbjct  188  YLFSNRGTPASYRTMNGYSGHTYKWYNSKGEWVYVQVHFIANQGVHNLLDEEAGRLAGED  247
 
213
 
 
214
Query  234  PDYSKRELWRTIENGKELSWTAYVQVMKPEDADPEKLGFDPFDVTKVWPKKQFPLQEFGK  293
 
215
            PD+S R+LW  IE G   SW  Y+Q M  E +  +KL F  FD+TKVWP K FPL+ FG+
 
216
Sbjct  248  PDHSTRDLWEAIEKGDYPSWECYIQTMTLEQS--KKLPFSVFDLTKVWPHKDFPLRHFGR  305
 
217
 
 
218
Query  294  LTLNKNPENFHRDVEQAAFSPGSMVPGIEDSPDPLLQFRMFFYRDAQYHRIGVNLHQVPV  353
 
219
             TLN+NP+N++ + EQ AFSP   VPG+E S DP+LQ R+F Y D   HR+G N HQ+PV
 
220
Sbjct  306  FTLNENPKNYYAETEQIAFSPSHTVPGMEPSNDPVLQSRLFSYPDTHRHRLGPNYHQIPV  365
 
221
 
 
222
Query  354  NCPFMASSYSSLNFDGQLRVDANHAMNPQYA  384
 
223
            NCP  + S++ +N DG + VD N    P YA
 
224
Sbjct  366  NCPLKSGSFNPINRDGPMCVDGNLGGTPNYA  396
 
225
 
 
226
 
 
227
>gi|49651945|emb|CAG78888.1| unnamed protein product [Yarrowia lipolytica CLIB99]
 
228
 gi|50557334|ref|XP_506075.1| hypothetical protein [Yarrowia lipolytica]
 
229
          Length=492
 
230
 
 
231
 Score =  331 bits (849),  Expect = 3e-90
 
232
 Identities = 189/438 (43%), Positives = 251/438 (57%), Gaps = 28/438 (6%)
 
233
 
 
234
Query  54   GSGAFGHFEVTKDVSDLTKAHFLRSPGIKTPVFIRFSTVTLGREYPDLARNPRGFAVKFY  113
 
235
            GSGA+G FEVT D++DL  A FL   G KT  F RFSTV   +   D AR+PRGFA KFY
 
236
Sbjct  60   GSGAYGEFEVTDDITDLNCADFLSKIGKKTKTFTRFSTVGGEKGSADAARDPRGFATKFY  119
 
237
 
 
238
Query  114  TGEGNYDIVGLNFPVFFCRDPIQGPDVIRSQYRNPQNFLLDHNSLFDLLANTPEGNHAGM  173
 
239
            T EGN D V  N PVFF RDP + P  I +Q RNP+  L D   ++D +AN  E  H  M
 
240
Sbjct  120  TDEGNIDWVYNNTPVFFIRDPSKFPVFIHTQKRNPETNLKDATMMWDYIANNQECCHQIM  179
 
241
 
 
242
Query  174  MFFSDHGTPAGWQNIHGYGCHTFKWVNAEGKFVYIKYHFLADHGQKQFNADEALRYGGED  233
 
243
            + FSD GTPA ++ ++GY  HT+KW+  +G F Y++ H   D G K    DEA+   G +
 
244
Sbjct  180  VLFSDRGTPANYRQMNGYSGHTYKWIKKDGSFNYVQIHMKTDQGIKNLTNDEAVALSGTN  239
 
245
 
 
246
Query  234  PDYSKRELWRTIENGKELSWTAYVQVMKPEDADPEKLGFDPFDVTKVWPKKQFPLQEFGK  293
 
247
            PD+++ +L+ +I++G   SWT YVQV  PE A  EKL +  FD+TKVWP  QFPL+ FGK
 
248
Sbjct  240  PDHAQEDLFNSIKSGSFPSWTCYVQVCTPEQA--EKLKWSVFDLTKVWPHDQFPLRRFGK  297
 
249
 
 
250
Query  294  LTLNKNPENFHRDVEQAAFSPGSMVPGIEDSPDPLLQFRMFFYRDAQYHRIGVNLHQVPV  353
 
251
            LTLNKN +N+  + EQAAFSP + VPG E S DP+LQ R+F Y D Q HR+G N  Q+PV
 
252
Sbjct  298  LTLNKNVQNYFAETEQAAFSPSNTVPGWETSADPVLQSRLFSYPDTQRHRLGTNFAQIPV  357
 
253
 
 
254
Query  354  NCPFMASSYSSLNFDGQLRVDANHAMNPQYAPNSFVHKFRTDTAEAPYQLADGTVSRKSH  413
 
255
            NCP+ A  ++  + DGQ+ V+ N    P Y P+SF           P Q        + H
 
256
Sbjct  358  NCPYHA--HTPYHRDGQMAVNGNSGSLPNY-PSSF----------EPLQYRQDINLHEKH  404
 
257
 
 
258
Query  414  FFHEGKASEY-----------DQPRELYERV-MDEKARQHLHTNTARLLKLVEYPKIQAK  461
 
259
                G+A  Y            QP EL++ +      ++HL  N A  L     P++Q K
 
260
Sbjct  405  EKWVGEAVAYQWVVGTDGVDFQQPAELWKVLGKTPDQQEHLVYNIAVSLSGAR-PEVQDK  463
 
261
 
 
262
Query  462  YLGQLLRISEKYARGVYD  479
 
263
              G   ++   + + V D
 
264
Sbjct  464  TFGMFDKVDAHFGKLVRD  481
 
265
 
 
266
 
 
267
>gi|56541435|dbj|BAD77826.1| catalase [Candida dubliniensis]
 
268
          Length=485
 
269
 
 
270
 Score =  323 bits (829),  Expect = 7e-88
 
271
 Identities = 166/390 (42%), Positives = 239/390 (61%), Gaps = 6/390 (1%)
 
272
 
 
273
Query  54   GSGAFGHFEVTKDVSDLTKAHFLRSPGIKTPVFIRFSTVTLGREYPDLARNPRGFAVKFY  113
 
274
            GSGA+G FEVT D++D+  A FL + G KT VF RFSTV       D AR+PRGFA KFY
 
275
Sbjct  56   GSGAYGVFEVTDDITDVCAAKFLDTVGKKTRVFTRFSTVGGELGSADTARDPRGFATKFY  115
 
276
 
 
277
Query  114  TGEGNYDIVGLNFPVFFCRDPIQGPDVIRSQYRNPQNFLLDHNSLFDLLANTPEGNHAGM  173
 
278
            T EGN D+V  N PVFF RDP + P  I +Q RNP+  L D N  +D L +  E  H  M
 
279
Sbjct  116  TEEGNLDLVYNNTPVFFIRDPSKFPHFIHTQKRNPETHLKDANMFWDYLTSNEESIHQVM  175
 
280
 
 
281
Query  174  MFFSDHGTPAGWQNIHGYGCHTFKWVNAEGKFVYIKYHFLADHGQKQFNADEALRYGGED  233
 
282
            + FSD GTPA ++ ++GY  HT+KW N +G++ Y++ HF++D G K    +EA    G +
 
283
Sbjct  176  ILFSDRGTPASYREMNGYSGHTYKWSNKKGEWFYVQVHFISDQGIKTLTNEEAGALAGSN  235
 
284
 
 
285
Query  234  PDYSKRELWRTIENGKELSWTAYVQVMKPEDADPEKLGFDPFDVTKVWPKKQFPLQEFGK  293
 
286
            PDY++ +L++ I  G   SWTAY+Q M   +A+ ++  F  FD+TKVWP K++PL+ FGK
 
287
Sbjct  236  PDYAQEDLFKNIAAGNYPSWTAYIQTM--TEAEAKEADFSVFDLTKVWPHKKYPLRRFGK  293
 
288
 
 
289
Query  294  LTLNKNPENFHRDVEQAAFSPGSMVPGIEDSPDPLLQFRMFFYRDAQYHRIGVNLHQVPV  353
 
290
             TLN+NP+N+  +VEQAAFSP   VP +E S DP+LQ R+F Y D   HR+G N  Q+PV
 
291
Sbjct  294  FTLNENPKNYFAEVEQAAFSPAHTVPYMEPSADPVLQSRLFSYADTHRHRLGTNYTQIPV  353
 
292
 
 
293
Query  354  NCPFMASSYSSLNFDGQLRVDANHAMNPQYAPNSFVHKFRTDTAEAPYQLADGTVSRKSH  413
 
294
            NCP   + ++    DG + V+ N   +P Y  +    +F+  + +   ++ +G     + 
 
295
Sbjct  354  NCPVTGAVFNPHMRDGAMTVNGNLGSHPNYLASDKPVEFKQFSLQEDQEVWNGAA---TP  410
 
296
 
 
297
Query  414  FFHEGKASEYDQPRELYERVMDEKARQHLH  443
 
298
            F  +   +++ Q +EL+ +V+     Q  H
 
299
Sbjct  411  FHWKATPADFKQAQELW-KVLKRYPNQQEH  439
 
300
 
 
301
 
 
302
>gi|40738591|gb|EAA57781.1| hypothetical protein AN5918.2 [Aspergillus nidulans FGSC A4]
 
303
 gi|49097190|ref|XP_410055.1| hypothetical protein AN5918.2 [Aspergillus nidulans FGSC A4]
 
304
          Length=501
 
305
 
 
306
 Score =  323 bits (828),  Expect = 9e-88
 
307
 Identities = 162/336 (48%), Positives = 214/336 (63%), Gaps = 6/336 (1%)
 
308
 
 
309
Query  54   GSGAFGHFEVTKDVSDLTKAHFLRSPGIKTPVFIRFSTVTLGREYPDLARNPRGFAVKFY  113
 
310
            G+GA+G FEVT D+SD+T    L+  G KT  F+RFSTV   +  PD AR+PRGFA KFY
 
311
Sbjct  69   GAGAYGEFEVTDDISDITVIDMLKGVGKKTKTFVRFSTVGGEKGSPDSARDPRGFACKFY  128
 
312
 
 
313
Query  114  TGEGNYDIVGLNFPVFFCRDPIQGPDVIRSQYRNPQNFLLDHNSLFDLLANTPEGNHAGM  173
 
314
            T EGN+D V  N PVFF RDP + P  I +Q RNPQ  L D    +D L+   E  H  M
 
315
Sbjct  129  TEEGNWDWVFNNTPVFFLRDPSKFPMFIHTQKRNPQTNLKDATMFWDYLSTHQEAVHQVM  188
 
316
 
 
317
Query  174  MFFSDHGTPAGWQNIHGYGCHTFKWVNAEGKFVYIKYHFLADHGQKQFNADEALRYGGED  233
 
318
              FSD GTP  +++++GY  HT+KW+  +G F Y++ H   D G K F   EA R   E+
 
319
Sbjct  189  HLFSDRGTPYSYRHMNGYSGHTYKWIKPDGTFNYVQLHLKTDQGNKTFTDAEATRLAAEN  248
 
320
 
 
321
Query  234  PDYSKRELWRTIENGKELSWTAYVQVMKPEDADPEKLGFDPFDVTKVWPKKQFPLQEFGK  293
 
322
            PD+  ++L+  I  G+  SWT YVQ + PE A  EK  ++ FD+TKVWP+ + PL+ FG+
 
323
Sbjct  249  PDWHTQDLFNAIARGEYPSWTCYVQTLSPEQA--EKFRWNIFDLTKVWPQSEVPLRRFGR  306
 
324
 
 
325
Query  294  LTLNKNPENFHRDVEQAAFSPGSMVPGIEDSPDPLLQFRMFFYRDAQYHRIGV-NLHQVP  352
 
326
             TLNKNPEN+  +VEQAAFSP  +VPG+E S DP+LQ R+F Y D   HR+G  N   +P
 
327
Sbjct  307  FTLNKNPENYFAEVEQAAFSPSHLVPGVEPSADPVLQARLFSYPDTHRHRLGTSNYQSIP  366
 
328
 
 
329
Query  353  VNCPFMASSYSSLNFDGQLRVDANHAMNPQYAPNSF  388
 
330
            VNCP  A  ++  + DG + V+ NH  NP Y P++F
 
331
Sbjct  367  VNCPLRA--FTPFHRDGAMSVNGNHGANPNY-PSTF  399
 
332
 
 
333
 
 
334
>gi|46440608|gb|EAK99912.1| hypothetical protein CaO19.6229 [Candida albicans SC5314]
 
335
 gi|46440519|gb|EAK99824.1| hypothetical protein CaO19.13609 [Candida albicans SC5314]
 
336
 gi|2317282|dbj|BAA21767.1| catalase [Candida albicans]
 
337
          Length=485
 
338
 
 
339
 Score =  323 bits (828),  Expect = 9e-88
 
340
 Identities = 165/390 (42%), Positives = 239/390 (61%), Gaps = 6/390 (1%)
 
341
 
 
342
Query  54   GSGAFGHFEVTKDVSDLTKAHFLRSPGIKTPVFIRFSTVTLGREYPDLARNPRGFAVKFY  113
 
343
            GSGA+G FEVT D++D+  A FL + G KT +F RFSTV       D AR+PRGFA KFY
 
344
Sbjct  56   GSGAYGVFEVTDDITDICAAKFLDTVGKKTRIFTRFSTVGGELGSADTARDPRGFATKFY  115
 
345
 
 
346
Query  114  TGEGNYDIVGLNFPVFFCRDPIQGPDVIRSQYRNPQNFLLDHNSLFDLLANTPEGNHAGM  173
 
347
            T EGN D+V  N PVFF RDP + P  I +Q RNP+  L D N  +D L +  E  H  M
 
348
Sbjct  116  TEEGNLDLVYNNTPVFFIRDPSKFPHFIHTQKRNPETHLKDANMFWDYLTSNEESIHQVM  175
 
349
 
 
350
Query  174  MFFSDHGTPAGWQNIHGYGCHTFKWVNAEGKFVYIKYHFLADHGQKQFNADEALRYGGED  233
 
351
            + FSD GTPA ++ ++GY  HT+KW N +G++ Y++ HF++D G K    +EA    G +
 
352
Sbjct  176  VLFSDRGTPASYREMNGYSGHTYKWSNKKGEWFYVQVHFISDQGIKTLTNEEAGALAGSN  235
 
353
 
 
354
Query  234  PDYSKRELWRTIENGKELSWTAYVQVMKPEDADPEKLGFDPFDVTKVWPKKQFPLQEFGK  293
 
355
            PDY++ +L++ I  G   SWTAY+Q M   +A+ ++  F  FD+TKVWP K++PL+ FGK
 
356
Sbjct  236  PDYAQEDLFKNIAAGNYPSWTAYIQTM--TEAEAKEAEFSVFDLTKVWPHKKYPLRRFGK  293
 
357
 
 
358
Query  294  LTLNKNPENFHRDVEQAAFSPGSMVPGIEDSPDPLLQFRMFFYRDAQYHRIGVNLHQVPV  353
 
359
             TLN+NP+N+  +VEQAAFSP   VP +E S DP+LQ R+F Y D   HR+G N  Q+PV
 
360
Sbjct  294  FTLNENPKNYFAEVEQAAFSPAHTVPYMEPSADPVLQSRLFSYADTHRHRLGTNYTQIPV  353
 
361
 
 
362
Query  354  NCPFMASSYSSLNFDGQLRVDANHAMNPQYAPNSFVHKFRTDTAEAPYQLADGTVSRKSH  413
 
363
            NCP   + ++    DG + V+ N   +P Y  +    +F+  + +   ++ +G     + 
 
364
Sbjct  354  NCPVTGAVFNPHMRDGAMTVNGNLGSHPNYLASDKPVEFKQFSLQEDQEVWNGAA---TP  410
 
365
 
 
366
Query  414  FFHEGKASEYDQPRELYERVMDEKARQHLH  443
 
367
            F  +   +++ Q +EL+ +V+     Q  H
 
368
Sbjct  411  FHWKATPADFKQAQELW-KVLKRYPNQQEH  439
 
369
 
 
370
 
 
371
>gi|56541439|dbj|BAD77828.1| catalase [Candida tropicalis]
 
372
          Length=485
 
373
 
 
374
 Score =  321 bits (823),  Expect = 3e-87
 
375
 Identities = 171/436 (39%), Positives = 254/436 (58%), Gaps = 11/436 (2%)
 
376
 
 
377
Query  54   GSGAFGHFEVTKDVSDLTKAHFLRSPGIKTPVFIRFSTVTLGREYPDLARNPRGFAVKFY  113
 
378
            GSGA+G FEVT D++D+  A FL + G KT +F RFSTV       D AR+PRGFA KFY
 
379
Sbjct  56   GSGAYGVFEVTDDITDICAAKFLDTVGKKTRIFTRFSTVGGEAGSADTARDPRGFATKFY  115
 
380
 
 
381
Query  114  TGEGNYDIVGLNFPVFFCRDPIQGPDVIRSQYRNPQNFLLDHNSLFDLLANTPEGNHAGM  173
 
382
            T EGN D+V  N PVFF RDP + P  I +Q RN +  L D N  +D L +  E NH  M
 
383
Sbjct  116  TEEGNLDLVYNNTPVFFIRDPSKFPHFIHTQKRNSETHLKDANMFWDYLTSNEESNHQVM  175
 
384
 
 
385
Query  174  MFFSDHGTPAGWQNIHGYGCHTFKWVNAEGKFVYIKYHFLADHGQKQFNADEALRYGGED  233
 
386
            + FSD GTPA ++ ++GY  HT+KW N +G++ Y++ HF+ D G K    +EA    G +
 
387
Sbjct  176  ILFSDRGTPASYREMNGYSGHTYKWSNKKGEWHYVQVHFITDQGNKTLTNEEAGSLAGSN  235
 
388
 
 
389
Query  234  PDYSKRELWRTIENGKELSWTAYVQVMKPEDADPEKLGFDPFDVTKVWPKKQFPLQEFGK  293
 
390
            PDY++ +L++ +  G   SWT Y+Q M   +A  ++  F  FD+TKVWP  ++PL+ FGK
 
391
Sbjct  236  PDYAQEDLFKNMLAGNYPSWTCYIQTM--TEAQAKEADFSVFDLTKVWPHGKYPLRRFGK  293
 
392
 
 
393
Query  294  LTLNKNPENFHRDVEQAAFSPGSMVPGIEDSPDPLLQFRMFFYRDAQYHRIGVNLHQVPV  353
 
394
             TLN+NP+N+  +VEQAAFSP   VP +E S DP+LQ R+F Y D   HR+G N  Q+PV
 
395
Sbjct  294  FTLNENPKNYFAEVEQAAFSPAHTVPYMEPSADPVLQSRLFSYSDTHRHRLGTNYTQIPV  353
 
396
 
 
397
Query  354  NCPFMASSYSSLNFDGQLRVDANHAMNPQYAPNSFVHKFRTDTAEAPYQLADGTVSRKSH  413
 
398
            NCP   + ++    DG + V+ N   +P Y  +    +F+  + +   ++  G     + 
 
399
Sbjct  354  NCPVTGAVFNPHMRDGAMNVNGNLGSHPNYLASDKPIEFKQFSLQEDQEVWHGAA---TP  410
 
400
 
 
401
Query  414  FFHEGKASEYDQPRELYERVMD-EKARQHLHTNTARLLKLVEYPKIQAKYLGQLLRISEK  472
 
402
            F  +   +++ Q +EL++ +      ++HL  N A      + P IQ K +    ++S +
 
403
Sbjct  411  FHWKATPADFKQSQELWKVLKRYPNQQEHLAHNVAVHASAADAP-IQDKVIAYFAKVSPE  469
 
404
 
 
405
Query  473  YA----RGVYDLLPEK  484
 
406
             +    + + +L P K
 
407
Sbjct  470  LSNLIKKEILELSPRK  485
 
408
 
 
409
 
 
410
Database: All non-redundant GenBank CDS translations+PDB+SwissProt+PIR+PRF excluding 
 
411
environmental samples
 
412
  Posted date:  Jun 8, 2005  3:44 AM
 
413
Number of letters in database: 849940114
 
414
Number of sequences in database:  2506223
 
415
Lambda     K      H
 
416
   0.321    0.138    0.437 
 
417
Gapped
 
418
Lambda     K      H
 
419
   0.267   0.0410    0.140 
 
420
Matrix: BLOSUM62
 
421
Gap Penalties: Existence: 11, Extension: 1
 
422
Number of Sequences: 147123
 
423
Number of Hits to DB: 13821951
 
424
Number of extensions: 654954
 
425
Number of successful extensions: 1258
 
426
Number of sequences better than 10: 15
 
427
Number of HSP's better than 10 without gapping: 14
 
428
Number of HSP's gapped: 1225
 
429
Number of HSP's successfully gapped: 15
 
430
Number of extra gapped extensions for HSPs above 10: 1206
 
431
Length of query: 528
 
432
Length of database: 849940114
 
433
Length adjustment: 116
 
434
Effective length of query: 412
 
435
Effective length of database: 69377587
 
436
Effective search space: 28583565844
 
437
Effective search space used: 21552263428
 
438
T: 11
 
439
A: 40
 
440
X1: 16 (7.4 bits)
 
441
X2: 38 (14.6 bits)
 
442
X3: 64 (24.7 bits)
 
443
S1: 41 (20.4 bits)
 
444
S2: 69 (31.2 bits)